南方四合院，也是四面合围而成的一种合院式建筑，与北方四合院有着显著的区别，主要体现在以下几个方面：
占地面积：南方四合院的占地面积一般都比较小，不如北方四合院那样奢侈。
建筑层数：南方四合院的建筑层数通常比较高，两三层都算是普通的。高层处会对外开窗，保证采光和通风。
设计风格：南方四合院的设计风格十分别致，不光有弧度更大的飞檐翘脚，还有更加细致的三雕用于装饰建筑各处。
建筑材料：南方四合院的建筑材料通常选用砖和木头，裸露在外的部分通常会进行雕饰。
结构布局：南方农村四合院的结构布局一般呈“口”字形，中央为天井。也有多进式的院落组合，即一个宅院有着多个天井结构。
南方四合院与北方不同，庭院没有那么宽敞，但却避免了夏天的暴晒。墙体厚度也不如北方四合院那般厚重，因此显著的节省了建筑材料，使之可以向高度上扩展，有效增加了居住的空间。也就是说，南方四合院也是根据当地气候和居住习惯设计的，足见中国人在建筑设计方面的智慧。
