最完整的四合院是三进院落，房屋有正房、厢房、耳房、倒座房、后罩房，这些房屋除了耳房之外，全都是互相分离的，既有自己的独立空间，又组合在一起。下面，就分别来说说北京四合院的房屋。
北京四合院的正房一般是面阔三间或者五间，进深方向经常采用七檩构架，也就是安排七根檩条，前后共四排柱子，两面都设有外廊，显得宽敞明亮。
一些小四合院的正房可以只设前廊或者前后都不设廊子。由于正房是整个住宅中等级最高的建筑，其屋顶不但要高处厢房、耳房一大截，而且有时还带有屋脊，更显得比其他的卷棚屋顶高大许多。
正房中央的明间一般用作起居厅，次间或者稍间用作主人的卧室。北京冬季寒冷，卧室中经常设有炕。这些炕都紧靠前槛墙或者后檐墙，下面挖有坑洞与外面相连，冷天时可以在外面添柴烧火，把炕烧热。
东西厢房大多是三间，比正房要矮一些。多数厢房带有前廊而不设后廊，这样有可能出现前檐低而后檐高的现象，工匠把这种样式叫“撅尾巴房”。当然，只要对梁架略做调整，使得两面的屋檐高度一致，也可以避免“撅尾巴”。一些小四合院也可以不设廊子。
耳房一般位于正房两侧，紧贴着正房的山墙，大多只有一间，少数为二间，格局很小，通常用作辅助用房或者储藏室，也可以用作卧室和书房。一些大四合院的厢房一侧也可能设置耳房，情形类似。另外，为了节约建造成本，耳房有时也会做成简单的平顶形式。
倒座房又称南房，是宅院南边紧邻胡同的房子，基本不开后窗，门窗朝向北边，与正房相对。倒座房位置不好，所以基本不住人，一般是用来接待客人或是私塾之用。另外，倒座房位于外院，与其他房屋分隔。
后罩房是宅院的最后一排房子，是最隐秘的位置。因此，这里常常是家族中女眷的居所，尤其是未出阁的姑娘。后罩房有时候会建成两层，这时就不能称之为后罩房了，而是称之为后罩楼。
