四合院建筑自古以来都是木架结构，因此防潮问题是古代工匠关注的焦点。那么，古人是如何实现木结构的防潮问题呢?
首先来说，古人对木质结构的保护非常上心。外部裸露的木结构，不仅利用瓦当滴水了避免木结构与雨水直接接触，甚至还在外面涂抹油漆彩绘，进一步隔绝雨水。对于埋在墙内的木结构，则在墙上开个洞，来保证通风，这个洞就是透风了。
对于柱子来说，深埋地下更容易受到腐蚀，因此会在柱子根基处加上一个叫做柱础的构件，除了稳定柱子之外，还避免柱子与泥土直接接触受潮。
对于现代建筑来说，除了上述这些防潮措施之外，还有了更为现代化的防潮手段。现在四合院建造防潮，关注的是湿气和雨水的控制，避免木材直接与湿气和雨水接触。因此，可以使用防薄膜、泛水板、外墙和屋面终饰层和填缝剂作为防雨层。在风压大，雨水多的地区，可能会设计防雨幕墙系统。
对于木结构四合院来说，为了可以长时间屹立不倒，那么木结构的防潮至关重要。当然，除了防潮之外，防虫蛀也非常重要。因为这两点，木结构四合院的维护成本比较高，如果自建四合院，可以考虑维护成本较低的框架结构。
