北京四合院是非常讲究绿化的，院内除通向各房间的十字形砖南路外，其余都是土地，可以用来植树、栽花、种草。除了中间的庭院之外，四合院的前院也会栽种树木，优化四合院的整体环境。可以说，四合院的绿化是老北京人闲时最爱做的事情。
在四合院的前院，一般是种植槐树以及榆树，这和老北京人的信仰和习俗有关。而四合院的内院则比前院丰富的多了，比如在十字形甬路的中心位置，常常放一只荷花缸或鱼缸，缸内植荷养鱼。在正房前的绿地上，常采用的树种有海棠、丁香、槐树、枣树、石榴等，春可赏花，夏可纳凉，秋季结果，可谓春华秋实。
四合院的庭院不仅可以植树，还会种植各种花卉，让四合院整年的大部分时间都可以看到何种绽放的花朵。北京四合院里常种的花卉有菊花、牡丹、芍药、藤萝、茉莉、黄花、夹竹桃、榆叶梅，背荫处还可栽玉簪花。除去种在地上的花卉外，还有很多盆栽，可以任意搬动摆放，点缀庭院。四合院这一片小小天地，一年之中春、夏、秋三季花木扶疏，清香四溢，沁人心脾，情深味浓。
北京四合院除去一般性的庭院绿化外，在北京的四合院住宅中，附设私家园林者不乏其例。有些较为著名的花园，如今还基本保留着原来的面貌。北京现存的四合院住宅，大多是晚清和民国初年的遗物。
四合院设计，其实不仅仅要设计整体布局和内部装潢，甚至连庭院也需要精心设计，让庭院整体环境更加舒适。
